Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 458.3 ms