Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms