Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cldn22Q9D7U6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cldn22Q9D7U6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cldn22Q9D7U6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cldn22Q9D7U6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cldn22Q9D7U6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms