Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf225Q9D7D1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf225Q9D7D1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms