Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms