Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms