Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PudpQ9D5U5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PudpQ9D5U5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms