Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms