Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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PrameQ9D4Z5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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PrameQ9D4Z5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrameQ9D4Z5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PrameQ9D4Z5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PrameQ9D4Z5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PrameQ9D4Z5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PrameQ9D4Z5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PrameQ9D4Z5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PrameQ9D4Z5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PrameQ9D4Z5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrameQ9D4Z5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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