Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms