Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpn3Q9D3W4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms