Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pus10Q9D3U0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms