Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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Krt20Q9D312 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Krt20Q9D312 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Krt20Q9D312 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Krt20Q9D312 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Krt20Q9D312 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Krt20Q9D312 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Krt20Q9D312 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Krt20Q9D312 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Krt20Q9D312 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt20Q9D312 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Krt20Q9D312 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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