Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms