Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim42Q9D2H5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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