Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms