Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Susd3Q9D176 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms