Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl52Q9D0Y8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl52Q9D0Y8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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