Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e1Q9D0D5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms