Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acsl3Q9CZW4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsl3Q9CZW4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms