Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Shmt2Q9CZN7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Shmt2Q9CZN7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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