Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms