Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms