Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpl11Q9CXW4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl11Q9CXW4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms