Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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SdhdQ9CXV1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SdhdQ9CXV1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SdhdQ9CXV1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SdhdQ9CXV1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SdhdQ9CXV1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SdhdQ9CXV1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SdhdQ9CXV1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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SdhdQ9CXV1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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SdhdQ9CXV1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SdhdQ9CXV1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SdhdQ9CXV1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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