Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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