Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ist1Q9CX00 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ist1Q9CX00 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ist1Q9CX00 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms