Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxxc1Q9CWW7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxxc1Q9CWW7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms