Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prkrip1Q9CWV6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkrip1Q9CWV6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms