Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Khdc3Q9CWU5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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