Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd12Q9CWU0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms