Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx28Q9CWT6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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