Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms