Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms