Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snw1Q9CSN1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snw1Q9CSN1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snw1Q9CSN1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snw1Q9CSN1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snw1Q9CSN1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snw1Q9CSN1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snw1Q9CSN1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snw1Q9CSN1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snw1Q9CSN1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snw1Q9CSN1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms