Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms