Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl28Q9CR40 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl28Q9CR40 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms