Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg12Q9CQY1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms