Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PclafQ9CQX4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PclafQ9CQX4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PclafQ9CQX4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms