Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer1Q9CQL2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms