Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufb9Q9CQJ8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms