Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpa3Q9CQ71 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms