Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms