Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim3Q99PE5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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