Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2ird2Q99NI3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms