Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cep41Q99NF3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cep41Q99NF3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cep41Q99NF3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cep41Q99NF3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cep41Q99NF3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms