Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b1Q99NB9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms