Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdk5rap3Q99LM2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms