Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Nus1Q99LJ8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nus1Q99LJ8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms