Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnpo2Q99LG2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnpo2Q99LG2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms